プロトコルやバッファー付きのキットになった

Click-iT® RNA Imaging & HCS Assays


特長

  • 細胞や組織における、全体的なRNA合成の時間空間的な検出を可能にしました。
  • EUがキットになり、新生RNA合成のイメージングやHCSアッセイが容易になりました。 迅速で高感度で便利。
  • Total RNAの平均35ウリジン残基ごとに1個取り込みます。
  • 標識パルス時間の長さを変えて、バルクのRNAのターンオーバーをイメージングで調べられます。
  • ホールマウント(whole-mount)でも切片でも転写活性全体が高いかどうかをイメージングで検出できます。
  • その他、Click-iT共通の特長を持ちます
  • 組み合わせる検出試薬によって、蛍光顕微鏡、フローサイトメトリー、ハイコンテントイメージング(HCS)で解析
  • PNAS論文より:Jao CY, Salic A (2008) PNAS,105: 15779 - 15784.
    Exploring RNA transcription and turnover in vivo by using click chemistry  全文はこちらから


  • 注.標識後のシークエンシングは勧められません。新生合成の検出用です。

イメージングのワークフロー

  1. 細胞をプレート
  2. オプション:テスト化合物や薬剤処理
  3. EUで細胞をインキュベート
  4. 細胞を固定して透過処理
  5. EUを検出
  6. Click-iT® reaction rinse buffer で細胞を洗浄
  7. オプション:他の固定細胞染色と抗体で細胞を染色。
  8. イメージング

RNAの細胞内局在性

  1. 正常なRNA合成を抑えるためにアクチノマイシンで細胞を処理し、ウイルスを感染
  2. ウイルス核タンパク質と共局在することにより新生のRNA合成が開始するかどうかEUで標識して観察
Click-iT® RNA Imaging Assay
ウィルス核タンパク質
重ね合わせ
ウイルスで処理された細胞の転写部位を示すEUとウィルス核タンパク質の局在性が一致
Vero cell cultures infected with Tacaribe virus were pretreated with 2 μM Actinomycin D and incubation was continued in the presence of 1 mM EU.
Cultures were fixed with cold MeOH, permeabilized using Triton® X-100 and incorporated EU detected with Click-iT® RNA Alexa Fluor® 488 Imaging assay (C10329). Virus nucleoprotein was detected using an Alexa Fluor® 594 labeled monoclonal antibody.

定量分析

示した量のアクチノマイシンDでHeLa細胞を18時間処理。
5-ethynyl uridine(EU;カタログ番号E10345)で、RNA合成に対するその影響をアッセイ。
1 mM EUで細胞を1時間培養。
それから細胞は固定し透過処理し、新しく合成されたRNAに取り込まれたEUを、緑色蛍光のAlexa Fluor® 488 azide(カタログ番号A10266)を用いて、Click-iT® Cell Reaction Buffer Kit (カタログ番号C10269)を用いて検出。
定量分析は、Thermo Scientific Cellomics® ArrayScan® VTI と コンパートメント解析バイオアプリケーションを用いて行ないました。

製品情報

製品名
サイズ
製品番号
Click-iT® RNA Alexa Fluor® 488 HCS Assay *2-plate size*
1 kit
C10327
Click-iT® RNA Alexa Fluor® 594 HCS Assay *2-plate size* 1 kit C10328
Click-iT® RNA Alexa Fluor® 488 Imaging Kit *for 25 coverslips* 1 kit C10329
Click-iT® RNA Alexa Fluor® 594 Imaging Kit *for 25 coverslips* 1 kit C10330
5-ETHYNYL URIDINE 5 mg E10345

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